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小洁老师发布 monocle 2.40.1030 修复版,解决 Monocle2 超 46,340 细胞拟时序报错
超过5万细胞,再大的服务器也跑不通 Monocle2?让我来救你
AI 导读
生信技能树小洁老师发布 monocle 2.40.1030 修复版源码包,解决 Monocle2 在细胞数超过 46,340 时 orderCells() 拟时序计算报整数溢出错误的问题。报错源于 R 4.5.2 及之后版本中 stats 包 as.matrix.dist() 改用 size * size 计算距离矩阵位置总数,46,341 个细胞的平方值 2,147,488,281 超出 R integer 上限 2147483647,增加服务器内存无法解决。
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