David Baker 团队在 Nature 发表两项从头设计蛋白酶研究

华盛顿大学 David Baker 团队在 Nature 发表两篇文章，分别报告从头设计的半胱氨酸蛋白酶和锌离子辅助催化的金属蛋白酶。半胱氨酸蛋白酶研究以 Ulp1 的局部催化几何为依据，检测 69 个候选设计，13 个在融合体系中表现出切割活性，初筛成功率约 19%；优化得到的 Dokki-v2 催化周转数为 0.064 s⁻¹，催化效率为 413 M⁻¹·s⁻¹，周转数较 Dokki-15 提高约 58 倍，六个晶体结构显示其折叠与已知天然蛋白酶明显不同。