用 SpatialData 与 Squidpy 分析 Xenium 空间转录组数据

以 10x Genomics 的 Xenium 人肺癌 FFPE 示例数据为例，演示了从下载解压到空间统计的完整分析流程。用 spatialdata_io 的 xenium() 将表达矩阵、细胞信息、转录本坐标、细胞边界与组织图像整合为 SpatialData 对象并写入 zarr，再经 scanpy 计算质控指标、按阴性对照探针与阴性对照编码占比评估背景，过滤后归一化、PCA、UMAP 与 Leiden 聚类。