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Cell:马越等揭示工业化驱动人类肠道细菌趋同基因组进化
Cell | 马越等揭示工业化驱动人类肠道细菌的趋同基因组进化
AI 导读
德国基尔大学Eric J. Alm、Mathieu Groussin和Mathilde Poyet团队(共同一作Malte Rühlemann和马越)在Cell发表论文,利用全球微生物组保护计划(GMbC)的肠道细菌分离株基因组资源,研究工业化生活方式对肠道细菌基因组进化的影响。研究建立了覆盖9个国家、24个地区和434个物种水平基因组簇的5981个高质量分离株基因组库,并比较147对同一样本同物种的分离株基因组与宏基因组组装基因组(MAGs),发现分离株能恢复更多蛋白质编码基因、代谢功能及移动遗传元件,检测到更多HGT事件。
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来源:公众号:BioArt · mp.weixin.qq.com
推荐理由
研究用5981个肠道细菌分离株基因组,比较工业化与非工业化人群菌株的基因获得与变异,为理解生活方式如何塑造肠道菌基因组提供证据。