圣安德鲁斯大学研究:腕足动物与苔藓虫、帚虫共享蠕虫状祖先
圣安德鲁斯大学团队在 Science Advances 发表首个覆盖全部五个现生腕足动物目及相关类群的系统发育基因组学分析,确认腕足动物属于 Lophophorata 演化群,与苔藓虫和帚虫亲缘最近,三者共享一个演化出触手冠的蠕虫状祖先。研究还发现腕足动物外壳矿化方式在演化史上至少改变过一次,从方解石壳转向以磷酸钙为主的有机磷质壳。
圣安德鲁斯大学团队在 Science Advances 发表首个覆盖全部五个现生腕足动物目及相关类群的系统发育基因组学分析,确认腕足动物属于 Lophophorata 演化群,与苔藓虫和帚虫亲缘最近,三者共享一个演化出触手冠的蠕虫状祖先。研究还发现腕足动物外壳矿化方式在演化史上至少改变过一次,从方解石壳转向以磷酸钙为主的有机磷质壳。
日本埼玉大学等机构的研究发现,Hox9–10 基因在斑马鱼和伊比利亚肋螈后肢附肢形成的最早阶段均不可或缺,为脊椎动物成对附肢图式系统的演化组装提供了发育证据。
研究人员将一张哥伦比亚伊尼里达河自拍照中的巨型睡莲确认为新物种,命名为哥伦比亚王莲(Victoria colombiana),2026年10月9日发表于《植物分类学》(Phytotaxa)。团队通过卫星图像定位并赴雨林找到开花植株,结合形态特征与基因信息完成鉴定;野外估计仅剩约30~50株,处于极度濒危状态。王莲属(Victoria)确认种数由此增至4种。
浙江大学公共卫生学院徐小林团队基于中国、英国和美国3个全国性老龄化队列的纵向数据,纳入5495对跌倒者与未跌倒者共10990人(平均年龄71.0岁),发现跌倒相关的多维功能差异在跌倒前3至5年已出现并持续至跌倒后约5年。
中山大学马亮、陈雅萍团队联合多国研究人员在《科学》发表研究,将高精度海平面上升预测与物种精细化栖息地数据耦合,评估了全球34120种陆生脊椎动物(约90%已知物种)的暴露风险。
基于 UK Biobank 的 1.1 万例 MRI 与 Penn Medicine BioBank 的 0.8 千例 CT,比较不同线性指标对升主动脉扩张的分类表现,主动脉横截面积/身高是唯一能一致分类主动脉扩张的线性指标。结果发表于 JACCIMG 2025。
Victor de Lorenzo 指出,教科书中的 Luria-Delbrück 实验存在问题:并非所有突变都在选择压力之前自发产生,部分突变会在选择本身带来的诱变压力之后出现。该实验由 1969 年诺贝尔生理学或医学奖得主 Max Delbrück 参与建立,用于证明突变先于选择自发产生。
研究在 5 个有高质量 MAVE 数据的癌症相关基因上比较 MAVE 与 GEMME、EVE、CPT-1 等无人群依赖变异效应预测器的分类表现,发现 MAVE 按 ACMG/AMP 校准后更保守、判定更明确,而 VEP 整体能识别更广范围致病变异。
Jonathan Pritchard 分享新文章,提出人类遗传学下一代方向应建立“Trait Causal Models”,把遗传变异与各层级生物学结构中的效应连接起来。
推荐理由:作者提出用 GWAS、扰动实验与观察性组学构建连接遗传变异与各层级生物学效应的性状因果模型,为人类遗传学下一个阶段给出框架性设想。
中国科学家领衔的植物星球计划今年2月启动,全球40多家科研机构参与,目标是为缺乏参考基因组的陆地植物目、科、属采样,构建高分辨率、时间校准的陆地植物系统发育树。计划未来3年优先解码所有缺乏参考基因组的目和科,之后10—12年拓展到90%的被子植物属和90%非开花植物的科。专家提到 AI 可把跨物种基因注释从数月缩短到几天,并计划发现100种潜在经济作物和1000种活性天然产物用于药物开发。
推荐理由:计划给出分阶段基因组解码目标和 AI 加速注释的思路,可了解植物基因组学从模式物种走向全谱系的路径。
研究用 PRS-CSx 整合欧洲与东亚的冠状动脉疾病 GWAS 汇总数据,构建跨族裔多基因风险评分,并在中国慢性病前瞻性队列(CKB)的 72,782 人中外部验证。
诺丁汉大学与东北大学团队在日本野生Euhadra蜗牛中发现,肌球蛋白基因的自然差异决定壳的左右旋向,相关成果发表于Current Biology。该基因的微小变化通过影响胚胎早期细胞的顺时针或逆时针扭转,设定成体壳与器官的手性方向,且左旋与右旋个体均能正常发育。研究还借助日本山区左右旋个体可交配的种群,揭示左旋型存在自然选择证据。
Science Advances 发表研究,发现基质糖蛋白 Fibrillin-1(FBN1)是 Notch 调控的肌肉干细胞自主效应因子,对维持干细胞静息状态必不可少。
美国人类遗传学学会(ASHG)公布 2026 年专业奖项七位获奖者,涵盖终身成就、领导力、科学成就、早期职业与倡导等奖项,颁奖仪式将在本周会议期间举行。终身成就奖授予日本国立生物医学创新、健康与营养研究所所长 Yusuke Nakamura,其 VNTR 标记、APC 与结直肠癌遗传学及 BioBank Japan 等工作获认可。
古 DNA 与现代 DNA 证据提示夏威夷人群来自复活节岛,作者称这段跨赤道的独木舟航程约 7,000 公里。帖子附有斯坦福大学关于这项夏威夷遗传学研究的新闻链接。
研究用空间 Lotka–Volterra 竞争模型的解析近似证明,局域物种存续取决于各斑块总密度与局域排斥率的平衡,局域多物种共存由可行性域(feasibility domain)决定。
中国科学院昆明植物研究所团队在云南亚热带与热带森林发现真菌新科滇菌科,唯一成员命名为霸王滇菌,最高可达50厘米、单个体重超过两公斤,是目前子囊菌门记录到的最大子座。
利用高分辨率运动数据,研究估算了50种鸟类和蝙蝠在野外飞行时的运输成本,修正了经典的 locomotion 成本排序:飞行可能比游泳更省能,但代价接近奔跑,具体取决于物理环境、形态与行为的相互作用。将运输成本与大气条件关联,为预测风场变化如何重塑飞行动物的能量学、移动与分布提供了机制基础。
研究构建马达加斯加东南部某区的双年龄组空间显式疟疾模型,拟合实地病例报告与患病率数据,模拟IRS、LLIN补充覆盖和ACD三种干预在五种空间靶向情景下的效果。非靶向干预总体最有效但资源效率最低,基于空间中心性的靶向策略覆盖人口更多、运输资源更少。任何干预组合均未能消除该区疟疾,但高检测率下ACD可避免100%的重症疟疾病例。
中国科学院昆明植物研究所科学家在云南森林发现巨型野生菌霸王滇菌,并据此建立全新科——滇菌科,目前仅此一个成员。霸王滇菌属子囊菌门炭角菌目,是迄今已知体型最大的子囊菌之一,高约半米、重2公斤,其祖先约在6500万年前与常见炭角菌分家。研究推测它走“内生—腐生转换”路线,先潜伏健康树体,待树木死亡后优先分解木材,这或许是其长成巨无霸的原因之一;能否食用尚待食药用、发酵与栽培研究。
中国科学院南京地质古生物研究所团队在新疆准噶尔盆地中泥盆统呼吉尔斯特组约3.85亿年前的煤层中发现迄今最古老琥珀,将琥珀首发记录从约3.2亿年前推前6500万年。
多项生殖发育研究重新校准了经典模型与临床判断:CRISPR-Cas9删除牛胚胎IFNT全部功能性拷贝后,妊娠仍维持至足月并出生健康雌性犊牛;DNATypewriter记录一枚小鼠胚胎近两周发育,重建128万个转录组细胞的谱系树。
《Nature》综述 Overcoming key challenges in the evolutionary transition to multicellularity 整合比较研究与实验演化证据,重新梳理单细胞向多细胞转变的关键机制,提出多细胞生命的起步未必需要先演化出复杂发育程序。
推荐理由:综述把多细胞起源拆成群体形成、群体繁殖与功能整合三道关卡,并给出酵母演化实验等可检验证据。
Cell 在线发表的研究用蛋白质组学检测头足类 RNA 编辑产生的重编码位点,发现单个氨基酸编辑会改变蛋白质稳定性、亚细胞定位、翻译后修饰和细胞器功能。研究指出,鞘形亚纲头足类的 RNA 编辑水平远超其他动物,但其对蛋白质组的功能后果此前大多未知。
推荐理由:用蛋白质组学直接检测头足类 RNA 编辑位点的重编码产物,把编辑事件与蛋白稳定性、定位和修饰的变化联系起来。
南极棘鳍冰鱼 Harpagifer antarcticus 的新分相组装显示全基因组单倍型变异水平低,但存在多个 LINE-L2 支系的插入,提示持续转座可能参与物种形成。
一项发表于Genome Medicine的研究用定量演化框架分析2171份样本,区分突变率与选择,发现NOTCH1突变在组织学正常食管上皮克隆扩增中受强正选择,这解释了其在该组织中的高 prevalence。
推荐理由:研究用2171份样本区分突变率与选择,显示NOTCH1在正常食管上皮中受强选择,却与TP53、RB1呈拮抗上位性,抑制后续恶性演化。
研究利用 467,152 份 UK Biobank 基因组构建了全表型结构变异图谱,显示大于 50 bp 的结构变异是人类疾病风险中重要且此前被低估的来源。该资源揭示了与疾病相关的罕见结构变异和调控性结构变异,为理解人类生物学和药物研发提供线索。
推荐理由:基于近 50 万份 UK Biobank 基因组构建的结构变异图谱,把大于 50 bp 的变异与疾病风险系统关联起来,可作为结构变异研究的参考资源。
研究用新构建的 MacSyFinder2 模型对古菌 T4F 系统进行鉴定与分类,发现其多样性远超预期,许多生物携带一套或多套组装机器。基于结构系统发育分析显示,T4F 相关 ATPase 可变的 N 端结构域与子系统聚类一致,提示核心机器通过结构创新在古菌分泌 ATPase 家族内发生分化。
对达斡尔、鄂温克、鄂伦春三个阿穆尔-黑龙江河流域(AR)原住民族群共78人的高覆盖度全基因组测序显示,AR人群约1万至3000年前经历共同且持久的瓶颈效应。全基因组选择扫描发现SORBS2、PRKAG2、KCNMA1等冷适应候选位点,其等位基因频率与寒冷相关气候变量强相关,其中CHST11的尼安德特人来源等位基因rs11112181可能贡献冷适应变异。
一项基于英格兰全国数据的队列研究纳入 1107 例原发性线粒体病患者(中位年龄 48 岁,74% 为线粒体 DNA 诊断、26% 为核基因诊断),遗传诊断后 10 年生存率为 80.3%、20 年为 58.9%,高于此前预期。
Costantino 等系统刻画了表型测量尺度的选择如何影响常见遗传分析的结果,发现尺度选择可改变 GWAS 命中位点与 PGS × E 交互作用,并影响 PGS 在特定亚组中的表现。该研究发表于 Cell Genomics(在线优先),提示在生物样本库的基因-环境交互检验中不应忽视表型尺度的设定。
地球大脑健康委员会在《Nature Mental Health》发布首份报告,提出未来十年内任何重大环境干预的设计与评估都须纳入心理健康影响评估。报告指出极端天气、空气与噪声污染、城市压力源、生物多样性丧失及社会不平等与焦虑、抑郁、创伤相关障碍和认知衰退风险升高相关,并建议自2027年起将心理健康指标纳入气候计划、环境影响评估和城市政策。
中国科学院南京地质古生物研究所等整合百余种昆虫基因组与转录组数据,首次测定16种我国蜉蝣全基因组,证实古翅类为单系类群、蜉蝣目与蜻蜓目互为姊妹群。基于13个化石校准点的分子钟分析显示,冠群有翅昆虫可追溯至早泥盆世,古翅类冠群起源于晚泥盆世,昆虫翅只演化了一次。研究还发现不完全谱系分选与基因树估计误差共同导致以往组学数据难以阐明古翅类系统发育关系。
维也纳大学研究人员重建了章鱼、鱿鱼和乌贼基因组的 3D 组织,发现数亿年前的大规模 DNA 重排把原本分离的染色体区域拉到一起,可能促成新的基因调控网络。研究发表于 Nature Communications,显示染色质结构域在演化中长期稳定,而染色质环在物种、组织和发育阶段间差异明显,且多位于神经系统相关基因附近。作者指出,结果并未证明这些 DNA 变化直接导致头足类智力的演化。
基因组测序揭示水平基因转移(HGT)在微生物中远比此前假设的普遍,使生命之树的枝条交叉合并,模糊了物种边界。文章以临床微生物学家 Frank Koontz 对基因分类法的质疑为线索,梳理从 Linnaeus 到 Crick 提出“蛋白质分类学”的分类学史,并指出在美国工程微生物是否需接受监管审查取决于其外源 DNA 是否来自不同属。
用 CRISPR/Cas9 敲除家蚕 BmERR 的 AF-2 结构域后,BmTH、BmDDC、BmAA-NAT、Bmebony、Bmtan 等黑色素代谢基因表达受抑,酪氨酸与多巴积累,表皮斑纹缺失;过表达 BmERR 则斑纹加深。
在海鞘 Ciona 胚胎中,NKX2-3/5/6 同源基因 NK4 受 BMP 信号激活,作为转录抑制因子限制乳头调控基因 Foxg 的表达,使其局限于三个细胞簇,从而形成三个乳头。
Maria Martignoni 领衔、Canan Karakoç、Rebecca Tyson、Sam Brown 与 Jimmy Garnier 参与的论文《An eco-evolutionary consumer-resource theory of host-microbe symbioses》已被接收发表,DOI 为 doi.org/10.1093/jeb/。
Eric Topol 解读了 2026 年 10 月 9 日发表在 Immunity 的论文,该研究对 8 个国际队列、2,609 人、12,394,834 个白细胞做单细胞 RNA 测序,区分出以颗粒酶 K 或 B 为主的 CD8+ 效应记忆 T 细胞(TemK+ 与 TemB+)。
推荐理由:这篇解读梳理了 8 个队列、260 万白细胞的分析,把免疫衰老的细胞分叉与死亡风险联系起来。
中国科学院昆明动物研究所石磊团队联合国际同行,鉴定出古老保守基因CCNB1IP1在灵长类大脑中表达逐步升高,通过降解细胞周期相关转录因子促进基底祖细胞增殖,参与推动皮层扩张,成果发表于《自然·遗传学》。
推荐理由:研究把皮层扩张的线索指向古老基因CCNB1IP1的顺式调控元件演进,而非人类特有新基因。