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Journal of Chemical Information and Modeling·· 4 小时前AI 评分38

长时程分子动力学揭示 Sorcin 激活的配位偏倚构象选择机制

Long-Timescale Molecular Dynamics Reveal a Coordination-Biased Conformational Selection Mechanism for Sorcin Activation

AI 导读

在 Anton 3 专用超级计算机上开展的 9 条 10-μs 全原子分子动力学模拟(总计约 90 μs)显示,人源二聚体 Sorcin 的激活遵循配位偏倚的构象选择机制。从 Ca2+ 结合结构出发,去除 Ca2+ 后直接观察到活性态向非活性态的转变,说明 Ca2+ 配位丢失足以在微秒尺度驱动失活;保留离子的模拟中所有 EF-hand 位点均出现超快 Ca2+ 解离与再结合,提示其内在 Ca2+ 亲和力较弱、离子交换高度动态。

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来源:Journal of Chemical Information and Modeling · doi.org