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公众号:生信菜鸟团· 生信菜鸟团·· 13 小时前同新闻AI 评分81

CANVAS 用 H&E 重建肿瘤空间生态位,并在 149 例 NSCLC 免疫治疗队列中构建预后特征

空间蛋白组太贵?Cell 2026 的 CANVAS 尝试只用 H&E 重建肿瘤微环境的细胞邻域

AI 导读

生信菜鸟团解读了 Cell 2026 论文中 CANVAS 的后半部分工作:模型先在 457 位 NSCLC 患者、超过 1800 万个 CODEX 单细胞中定义 10 类 Cellular Neighborhoods,再借助 MUSK 病理基础模型从 H&E 预测对应的虚拟 habitat。作者把模型应用到 TCGA、PLCO、NLST 共 1693 位无 CODEX 数据的 NSCLC 患者,H&E 预测的 habitat 仍保留与生存相关的趋势;随后扩展到 8 个 TCGA 癌种的 3724 张切片,合计超过 5000 位患者、9 种癌症。

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来源:公众号:生信菜鸟团 · mp.weixin.qq.com

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