虚拟细胞联合时空多组学：从静态快照到动态生态型轨迹

生信人梳理了虚拟细胞与时空多组学结合的三类方法，用以回答靶向谁、在什么状态下靶向、什么时候靶向。时空动力学重构方面，2026年3月北京大学周沛劼团队与李铁军团队在Nature Methods发表stVCR，从多张非配对空间转录组快照端到端重构细胞分化、空间迁移与增殖凋亡；空间基础模型方面，Charlotte Bunne团队在Nature发表VirTues，在15个IMC队列、3102名患者、146种标记物上预训练，可从空间图像输出细胞定位与临床预后；虚拟扰动方面，Cell上的RegVelo联合RNA velocity与基因调控网络模拟转录因子敲除。