Scripps Research 获黄仁勋夫妇基金会捐赠 1400 万以上算力小时
Scripps Research 从 Jen-Hsun and Lori Huang Foundation 获得 1400 万以上算力小时。该资助由 @WardLab1 牵头,同时支持 @bryanbriney 和 @ForliLab 开展虚拟人体免疫系统与“暗”蛋白质组研究,并使用 @_chrisgparker_ 和 Benjamin Cravatt 的数据。
Scripps Research 从 Jen-Hsun and Lori Huang Foundation 获得 1400 万以上算力小时。该资助由 @WardLab1 牵头,同时支持 @bryanbriney 和 @ForliLab 开展虚拟人体免疫系统与“暗”蛋白质组研究,并使用 @_chrisgparker_ 和 Benjamin Cravatt 的数据。
粒曼生物于2026年10月完成数千万元天使轮融资,由上海弘晖领投,兴华鼎立和杭州润苗基金跟投,川越周期担任财务顾问。公司专注高通量细胞编辑与扰动样本数据生产,已完成覆盖人类19,883个基因的阵列式扰动文库建设与湿实验验证。
Arc Institute 的 2026 Virtual Cell Challenge 已有超过 5000 名注册者和 1500 支队伍进入排行榜,参赛者涵盖功能基因组学研究者、18 岁间隔年开发者与即将毕业的计算基因组学学生。
英矽智能在 2026 年 Pharma.AI 秋季网络研讨会上展示了 MMAI Gym 科学后训练与评估框架、五款专业模型、DDD Benchmark 与 O3DC 基准索引,以及 MCP 连接器。
推荐理由:英矽智能一次性展示了从后训练框架、专业模型到 MCP 接入的完整链路,可据此了解 AI 智能体编排药物发现的具体形态。
Mo Lotfollahi 表示癌症样本已到位并排队等待空间转录组检测,这些切片将成为虚拟生物学的训练数据,他期待 TERRA 及即将推出的多模态模型能从中学习,并估计数据量约 2 亿个细胞。
这篇综述从分子优化与系统级评估的衔接角度梳理 AI 驱动的 RNA 药物设计,比较 siRNA、反义寡核苷酸、适配体、mRNA 和翻译导向 circRNA 各自的设计约束,并评估序列模型、生成模型和结构感知模型的能力与局限。
推荐理由:综述把 RNA 药物设计从分子优化延伸到系统层面评估,梳理了不同 RNA 模态的设计约束与虚拟细胞的定位。
Biohub、美国能源部与 NIH 宣布投入 18 亿美元启动 Virtual Biology Initiative,用于生成开放、标准化的数据,训练预测细胞如何响应疾病与干预的 AI 模型。该计划定位为跨部门国际合作,目标是构建面向 AI 模型的基础数据。Loïc A. Royer 在 Bluesky 转述了这一消息并附上 biohub.org 的新闻链接。
推荐理由:这项近 20 亿美元的多机构投入指向开放标准化的细胞响应数据,为训练虚拟细胞类模型提供数据基础。
Max Jaderberg 表示,Isomorphic Labs 以创始成员身份加入 Virtual Biology Initiative,将参与生成可用于预测性生物学模型的 AI-ready 数据;其药物设计引擎 IsoDDE 已开发 5 年。
Isomorphic Labs 宣布以创始成员身份加入 Virtual Biology Initiative(VBI),将参与建设面向全球科研社区的开放资源,以加速对疾病的理解与治疗。
Isomorphic 宣布与美国能源部(DOE)和 NIH 建立重大合作,目标是生成构建准确细胞 AI 模型所需的数据。
推荐理由:美国能源部与 NIH 联合多家机构启动虚拟生物学计划,读者可了解细胞预测模型的数据来源与参与方。
Biohub 与美国能源部、NIH 及新资助伙伴宣布扩展虚拟生物学计划(Virtual Biology Initiative),合计投入 18 亿美元的资金、数据、算力和新测量技术。
推荐理由:这项跨机构投入给出了资金分配与数据标准化分工,可看清虚拟细胞所需开放数据从哪来、由谁整合。
Arc Institute 发布虚拟细胞模型 PIE(Perturbation is Everything),把 Cellosaurus、NCBI、Gene Ontology、DepMap、PubChem 等人工整理知识转成 token 输入,直接预测扰动后群体水平的差异表达基因、方向与幅度。
推荐理由:PIE 把人工整理的生物知识库转成输入,在未见扰动和细胞系上仍能预测差异表达,可看知识源如何影响泛化。
Arc Institute 为 2026 虚拟细胞挑战赛生成了覆盖六种细胞系的 Perturb-seq 数据,任务从去年的同细胞系少样本预测升级为跨细胞系的零样本预测。
推荐理由:Arc 披露 2026 虚拟细胞挑战赛数据集的生成与质控细节,可了解跨细胞系 Perturb-seq 数据如何做到一致可比。
aiAtlas version 1.2 模拟 136 个虚拟诱导多能干细胞来源细胞系,覆盖野生型、单突变、多突变、人肿瘤来源及基因融合等 ERCC2 状态,识别出约 20%–30%、约 50% 和超过 80% 三个非线性功能恢复阈值。
这篇 Perspective 提出用最小证伪框架检验生物机制算子能否提升单细胞扰动预测:在统一锁定评测下,与晚期融合、容量匹配静态模型、容量匹配学习动力学算子及拓扑重连对照比较。
一篇综述指出,当前 AI 虚拟细胞(VC)框架侧重遗传与药物扰动,环境扰动因数据可得性、化学空间覆盖和表征设计的结构性限制而建模不足。文章梳理了扰动预测模型从数学模型到深度学习与基础模型的演进,评估了基因组、转录组、蛋白组、代谢组和表型组等多模态 VC 进展,并提出标准化环境扰动数据集、多模态架构、不确定性感知评估指标和面向监管的基准框架,以推动计算模拟扰动与替代动物测试的 3Rs 范式。
这篇综述将肝脏 AI 虚拟细胞(AIVC)的建模路径归纳为三类:生成模型表征细胞状态,动力学与转运模型推断状态转换,预训练或基础模型检验表征能否跨供体、病因、疾病阶段和平台迁移,并以扰动响应预测作为贯穿性评估。
Arc 研究所启动 2026 虚拟细胞挑战赛,任务是在没有挑战赛专属训练数据的细胞情境中零样本预测扰动响应。Arc 团队为本次比赛专门生成了高质量单细胞 CRISPRi 扰动数据,覆盖 6 种细胞类型,参赛者需预测靶向特定基因后不同细胞类型的响应并达到实验精度。
推荐理由:Arc 研究所为虚拟细胞挑战赛专门生成了 6 种细胞类型的 CRISPRi 单细胞扰动数据,读者可据此了解零样本预测任务的评测设置。
GenBio AI 预览 AIDO Cell,一个覆盖 DNA、RNA、蛋白质与全细胞行为的模型,目标是让变异的后果可以被向前追踪而不只是被打分。
推荐理由:从进化序列预测结构到追踪变异在细胞中的后果,这条帖给出了新模型要解决的那层缺口。
Biohub 联合创始人 Priscilla Chan 发文回顾今年上半年进展,包括 5 月发布基于下一代 ESM 的蛋白质生物学世界模型,可预测蛋白折叠、相互作用与功能并设计新蛋白,已有科学家用它设计抗体候选并在早期实验室测试中针对癌症和免疫相关靶点显示初步结果。
推荐理由:Biohub 联合创始人以第一人称复盘半年进展,把蛋白世界模型、激光相位板与虚拟细胞计划串成一条开放科学路线。