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Nature Methods·· 11 小时前AI 评分60

CauTrigger:用分层因果分解解析生物系统状态转变

CauTrigger: deciphering biological system state transitions by hierarchical causal decomposition

AI 导读

CauTrigger 是一个分层深度潜变量模型,整合 do-calculus 来识别潜在的因果触发因素,并预测跨多个调控层的扰动结果。研究指出,生物系统存在复杂的多层调控,而观察性数据中的混杂因素会产生虚假关联,因此识别状态转变背后的因果结构仍然困难。CauTrigger 通过分离因果潜因子与虚假潜因子,递归重建底层调控层级,从而支持从观察性数据中进行可解释推理。在具有多层调控结构的合成数据集和真实数据集上,该方法在识别因果触发因素和预测系统级响应方面优于现有方法。

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来源:Nature Methods · doi.org