Journal of Chemical Information and Modeling·· 4 小时前AI 评分42
M-FRAG:在共享嵌入空间中对齐分子与片段,实现性质感知的片段选择
Aligning Molecules and Fragments in a Shared Embedding Space for Property-Aware Fragment Selection
AI 导读
M-FRAG 是一个性质感知框架,通过在共享嵌入空间中组织片段与母体分子的局部关系及其跨分子性质的全局分布,按与性质相关分子区域的距离和分布邻近性对候选片段排序,并用于指导基于强化学习的分子组装。在五个基于对接的多目标优化任务中,M-FRAG 相比本地评测中最强的主要基线将新颖命中率最高提升 58.00%,并在全部五个靶标上取得最佳 Novel Top-5% 对接分数,同时保持较强的新颖性与化学有效性。该工作将嵌入空间引导的片段选择确立为一种有效且可追溯的性质优化分子生成策略。
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来源:Journal of Chemical Information and Modeling · doi.org