清华张强锋团队在 Nature Methods 发表 CCI-seq，解析细胞互作网络与分子状态

清华大学张强锋等团队在 Nature Methods 发表研究，开发 CCI-seq 技术，将细胞间相互作用信息与高质量单细胞转录组连接起来。该方法先温和解离组织保留小型细胞团，用膜锚定寡核苷酸和三轮分池–混池组合索引标记细胞团，再完全解离并做单细胞测序，通过共享 Cell-ID 重新关联同一细胞团的细胞。人鼠混合细胞团验证中，4,042 个高质量 Cell-ID 细胞里 99.7% 人源细胞和 93.8% 鼠源细胞获得正确物种标签，682 个细胞团仅 2 个混有两种物种细胞。