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研究利用 AlphaFold 3 从序列预测 TCR 抗原特异性
General prediction of T cell receptor antigen specificity from sequence using AlphaFold 3
AI 导读
研究团队提出一种基于 AlphaFold 3（AF3）的通用方法，可从序列预测 T 细胞受体（TCR）的抗原特异性。作者将 AF3 用于超过 9000 个 TCR、1000 多个不同表位和 70 多种 MHC I/II 类等位基因，发现 AF3 能以很高准确度预测 MHC:肽:TCR 三元结构，并据此找出区分同源三元组与对照的特征。所得模型在 AF3 和特征选择均未见过的验证三元组上取得 0.81 至 0.92 的中位 AUC。作者认为，这提示从序列出发的 TCR 特异性通用预测是可行的，有望加速免疫应答的解析。
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来源：Science Advances · doi.org
推荐理由
该工作用 AlphaFold 3 预测 MHC:肽:TCR 三元结构，并据此构建可泛化到未见表位的 TCR 特异性预测模型。