RankMap：基于秩特征的参考映射工具，用于空间与单细胞转录组细胞类型注释

RankMap 是一个用于参考映射细胞类型注释的快速 R 包，已在 GitHub 开源。它用每个细胞高表达基因的秩特征表示细胞，以降低对平台间表达尺度差异的敏感性，再用弹性网正则化的多项回归预测细胞类型并给出置信度分数。作者在 5 个空间数据集（Xenium、MERFISH、Stereo-seq）和 2 个单细胞数据集上，将 RankMap 与 SingleR、Azimuth、RCTD 进行比较，结果显示其准确率具有竞争力，同时大幅缩短运行时间，在大规模空间数据集上尤为明显。作者认为 RankMap 为参考映射细胞类型注释提供了实用且可扩展的方案。