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Tahoe-100M亿级药物扰动单细胞图谱发表

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AI 综述

Tahoe Therapeutics 的 Johnny Yu 和 Hani Goodarzi 团队在 Cell 发表 Tahoe-100M,构建了超过 1 亿条单细胞转录组数据的药物扰动图谱。研究用 Mosaic 平台将 50 株来自 13 种组织来源的肿瘤细胞系混合共培养成三维球体,借助 SNP 信息溯源拆分,检测 379 种小分子药物、约 1100 组药物-剂量条件,其中近七成是 FDA 获批药物,每个细胞-药物-剂量条件中位数 1287 个细胞。 该图谱的适用条件有限:全部实验基于永生化肿瘤细胞系三维共培养体系,缺少原代细胞、类器官与体内组织;药物仅设置单一 24 小时处理时间点。 研究团队指出,部分转录衍生表型尤其是转录异质性指标在生物学重复间可重复性中等,相关假说仍需正交实验验证。

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10月27日
  1. 公众号:BioArt精选
    Tahoe-100M 亿级单细胞药物扰动图谱在 Cell 发表

    Tahoe Therapeutics 的 Johnny Yu 和 Hani Goodarzi 团队在 Cell 发表 Tahoe-100M,构建了超过 1 亿条高质量单细胞转录组数据的药物扰动图谱。研究用 Mosaic 高通量多重筛选平台把 50 株来自 13 种组织来源的肿瘤细胞系混合共培养成三维球体,借助 SNP 信息溯源拆分,检测 379 种小分子药物、约 1100 组药物-剂量条件,其中近七成是 FDA 获批药物,每个细胞-药物-剂量条件中位数 1287 个细胞。

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