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Tahoe-100M 亿级单细胞药物扰动图谱在 Cell 发表

Cell | Tahoe-100M:亿级单细胞图谱解码药物扰动下肿瘤细胞分子表型

AI 导读

Tahoe Therapeutics 的 Johnny Yu 和 Hani Goodarzi 团队在 Cell 发表 Tahoe-100M,构建了超过 1 亿条高质量单细胞转录组数据的药物扰动图谱。研究用 Mosaic 高通量多重筛选平台把 50 株来自 13 种组织来源的肿瘤细胞系混合共培养成三维球体,借助 SNP 信息溯源拆分,检测 379 种小分子药物、约 1100 组药物-剂量条件,其中近七成是 FDA 获批药物,每个细胞-药物-剂量条件中位数 1287 个细胞。

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来源:公众号:BioArt · mp.weixin.qq.com

推荐理由

图谱把药物扰动后的细胞命运分叉和脱靶效应放到单细胞层面观察,可作为扰动预测模型的训练资源参考。