粪便样本直接捕获测序隐孢子虫基因组

研究团队在《Nature Communications》发表方法：用 74,973 条 RNA 探针（CryptoCap_75K，8.2 Mb，取自 C. parvum 基因富集区）直接从患者粪便样本中富集隐孢子虫基因组 DNA 并测序。作者称，最少 25 个卵囊即可获得覆盖深度和广度足够的全基因组序列，对 Cryptosporidium ubiquitum 等分化较大的物种同样适用。 为减少参考偏倚，作者采用双比对策略，将 reads 同时比对到 C. parvum 和 C. ubiquitum。该研究据此重建隐孢子虫系统发育基因组关系，并报告分支特异基因组结构与宿主适应谱系。

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还没有足够的连续观测数据，暂不绘制趋势。