BarMix:262株酵母无标记条形码文库
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BarMix:262株酵母无标记条形码文库
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研究团队在《Genome Biology》发表 BarMix:用 CRISPR-Cas9 将无标记遗传条形码整合进 262 株酿酒酵母基因组,菌株覆盖野生、驯化和混合起源的多个系统发育分支,用于高通量适合度分析。 团队将混合文库在 33 种小分子化合物下做条形码测序定量适合度分析,通过全基因组关联分析鉴定出 281 个化学基因组互作,并用等位基因替换实验验证了其中 7 个关联等位基因。 作者称驯化分支与野生分支的化学适合度特征存在差异,尤其体现在影响麦角固醇合成、DNA 烷基化、微管解聚、TORC1 失活和膜通透性的胁迫下。
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最新进展10月28日 08:00
BarMix:基于 CRISPR-Cas9 的无标记条形码文库用于多株酿酒酵母化学基因组筛选报道时间线
沿着报道,了解事件的不同侧面。
10月28日
- Genome BiologyBarMix:基于 CRISPR-Cas9 的无标记条形码文库用于多株酿酒酵母化学基因组筛选
研究团队构建了 BarMix,一个基于 CRISPR-Cas9 将无标记遗传条形码整合进 262 株酿酒酵母基因组的条形码文库,这些菌株覆盖野生、驯化和混合起源的多个系统发育分支。他们用条形码测序对混合文库在 33 种小分子化合物下做定量适合度分析,通过全基因组关联分析鉴定出 281 个化学基因组互作。驯化分支与野生分支的化学适合度特征存在差异,尤其体现在影响麦角固醇合成、DNA 烷基化、微管解聚、TORC1 失活和膜通透性的胁迫下。
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