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Genome Biology·· 16 小时前AI 评分62

BarMix:基于 CRISPR-Cas9 的无标记条形码文库用于多株酿酒酵母化学基因组筛选

Chemogenomic profiling of diverse Saccharomyces cerevisiae strains using the novel CRISPR-Cas9 markerless barcoded library BarMix

AI 导读

研究团队构建了 BarMix,一个基于 CRISPR-Cas9 将无标记遗传条形码整合进 262 株酿酒酵母基因组的条形码文库,这些菌株覆盖野生、驯化和混合起源的多个系统发育分支。他们用条形码测序对混合文库在 33 种小分子化合物下做定量适合度分析,通过全基因组关联分析鉴定出 281 个化学基因组互作。驯化分支与野生分支的化学适合度特征存在差异,尤其体现在影响麦角固醇合成、DNA 烷基化、微管解聚、TORC1 失活和膜通透性的胁迫下。

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来源:Genome Biology · doi.org