厌氧消化微生物组数据库CAnDi发布
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厌氧消化微生物组数据库CAnDi发布
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研究团队发布厌氧消化微生物目录 CAnDi，从全球 1256 份反应器宏基因组样本中重建出 36 480 个原核基因组，覆盖 11 149 个物种。数据库可通过 https://www.candi-db.org/ 访问。 这些宏基因组还编码约 190 万条病毒序列和超过 13 万条质粒序列；聚类分析得到约 53.6 万个候选病毒物种，其中 85% 相对现有数据库为新，并识别出超过 15 000 个独特质粒。作者称该资源为研究产甲烷生态系统中病毒组和质粒组的生态与演化作用提供基础。
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最新进展10月31日 15:01
CAnDi 发布全球厌氧消化微生物组目录报道时间线
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10月31日
- Nucleic Acids ResearchCAnDi 发布全球厌氧消化微生物组目录
研究团队发布厌氧消化微生物目录 CAnDi，从全球 1256 份反应器宏基因组样本中重建出 36 480 个原核基因组，覆盖 11 149 个物种。这些宏基因组还编码约 190 万条病毒序列和超过 13 万条质粒序列；聚类分析得到约 53.6 万个候选病毒物种，其中 85% 相对现有数据库为新，并识别出超过 15 000 个独特质粒。作者从头构建了病毒与质粒蛋白家族聚类，分别得到 1 721 182 和 123 813 个不同蛋白家族。作者称该资源扩展了此前对厌氧消化微生物组的系统刻画，为研究产甲烷生态系统中病毒组和质粒组的生态与演化作用提供基础。
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