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非WGD肿瘤中检出活跃的全基因组加倍亚克隆

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AI 综述

一项发表于 Science Advances 的研究整合 bulk、单细胞和空间数据,在被归类为非全基因组加倍(nWGD)的肿瘤中检出普遍存在的全基因组加倍(WGD)细胞,且这些 WGD 亚克隆在扩增过程中持续获得体细胞拷贝数改变,提示其处于持续演化状态。 研究团队开发并验证了基于基因表达的 WAGES 方法,用于在 bulk 肿瘤中估计 WGD 细胞克隆比例。应用于 nWGD 肿瘤后,TP53 突变和染色体不稳定等基因组特征与 WGD 亚克隆的存在相符;WAGES 评分与肿瘤转移潜能、化疗和免疫治疗反应及患者预后呈较强相关。 作者据此提出 nWGD 肿瘤中广泛存在 WGD 亚克隆,并认为这些亚克隆对肿瘤演化和治疗结局有实质影响。

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10月31日
  1. Science Advances精选
    非WGD肿瘤中检出活跃的全基因组加倍亚克隆

    研究整合bulk、单细胞和空间数据,发现被归类为非全基因组加倍(non-WGD,nWGD)的肿瘤中仍普遍存在WGD细胞,且这些WGD亚克隆在扩增过程中持续获得体细胞拷贝数改变,提示其处于持续演化状态。作者开发并验证了基于基因表达的方法WAGES,用于在bulk肿瘤中估计WGD细胞克隆比例;将其应用于nWGD肿瘤后,发现TP53突变和染色体不稳定等基因组特征与WGD亚克隆的存在相符。WAGES评分与肿瘤转移潜能、化疗和免疫治疗反应以及患者预后均呈较强相关。研究据此提出nWGD肿瘤中广泛存在WGD亚克隆,并认为这些亚克隆对肿瘤演化和治疗结局有实质影响。

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