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非WGD肿瘤中检出活跃的全基因组加倍亚克隆
Evidence of active whole-genome doubling (WGD) subclones in non-WGD tumors
AI 导读
研究整合bulk、单细胞和空间数据,发现被归类为非全基因组加倍(non-WGD,nWGD)的肿瘤中仍普遍存在WGD细胞,且这些WGD亚克隆在扩增过程中持续获得体细胞拷贝数改变,提示其处于持续演化状态。作者开发并验证了基于基因表达的方法WAGES,用于在bulk肿瘤中估计WGD细胞克隆比例;将其应用于nWGD肿瘤后,发现TP53突变和染色体不稳定等基因组特征与WGD亚克隆的存在相符。WAGES评分与肿瘤转移潜能、化疗和免疫治疗反应以及患者预后均呈较强相关。研究据此提出nWGD肿瘤中广泛存在WGD亚克隆,并认为这些亚克隆对肿瘤演化和治疗结局有实质影响。
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来源:Science Advances · doi.org
推荐理由
研究提示被归为非WGD的肿瘤中仍普遍存在活跃演化的WGD亚克隆,并给出可从bulk数据估计其比例的表达方法。