SHAKIRA：用肿瘤RNA-seq推断遗传祖源
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SHAKIRA：用肿瘤RNA-seq推断遗传祖源
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AI 综述
研究团队在 BMC Bioinformatics 发表 SHAKIRA 流程，从肿瘤 RNA-seq 数据估计全球遗传祖源。作者先在 86 例胰腺神经内分泌肿瘤样本中，以 60% 祖源比例阈值判定主要祖源超级群体：39 名自报 Black 的患者中 38 名被判为非洲祖源为主，47 名自报 White 的患者全部被判为欧洲祖源为主。 随后作者用 144 例 CCLE 细胞系样本及已发表的 DNA 微阵列祖源估计做外部验证。作者称结果支持用 RNA-seq 变异估计宽泛遗传祖源的可行性，尤其是非洲和欧洲超级群体成分。
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最新进展11月3日 08:00
SHAKIRA：从 RNA-seq 比对结果推断祖源群体的层级化流程报道时间线
沿着报道，了解事件的不同侧面。
11月3日
- BMC BioinformaticsSHAKIRA：从 RNA-seq 比对结果推断祖源群体的层级化流程
研究团队提出 SHAKIRA，一个从肿瘤 RNA-seq 数据估计全球遗传祖源的生物信息学流程，并评估了其性能。作者先将其用于 86 例胰腺神经内分泌肿瘤样本，以 60% 祖源比例阈值判定主要祖源超级群体，39 名自报为 Black 的患者中 38 名被判定为非洲祖源为主，47 名自报为 White 的患者全部被判定为欧洲祖源为主。
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