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BMC Bioinformatics·· 11 小时前AI 评分58

SHAKIRA:从 RNA-seq 比对结果推断祖源群体的层级化流程

SHAKIRA: Scaled hierarchical ancestry K-population inference from RNA-seq alignments

AI 导读

研究团队提出 SHAKIRA,一个从肿瘤 RNA-seq 数据估计全球遗传祖源的生物信息学流程,并评估了其性能。作者先将其用于 86 例胰腺神经内分泌肿瘤样本,以 60% 祖源比例阈值判定主要祖源超级群体,39 名自报为 Black 的患者中 38 名被判定为非洲祖源为主,47 名自报为 White 的患者全部被判定为欧洲祖源为主。

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来源:BMC Bioinformatics · doi.org