LoGIC跨物种局部基因簇目录发布
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LoGIC跨物种局部基因簇目录发布
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Nucleic Acids Research 作者团队发布 LoGIC（Local Gene-cluster Integrative Catalog）数据库，收录从 30 个代表性真核物种中鉴定出的 20 306 个局部基因簇。 用户可查看每个基因簇的基本基因组特征、簇内基因成员的序列相似性、同一物种内成簇基因的功能偏好，以及基因簇的跨物种保守性；针对人类基因簇，数据库还提供组织范围表达谱及与染色质 Hi-C 结构关系的信息。 作者称，LoGIC 可用于串联基因重复、旁系同源基因功能分化、谱系特异性基因家族扩张以及同源基因簇跨物种演化保守或重塑等研究。
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最新进展10月31日 15:00
LoGIC 数据库发布跨物种局部基因簇整合目录报道时间线
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10月31日
- Nucleic Acids ResearchLoGIC 数据库发布跨物种局部基因簇整合目录
LoGIC（Local Gene-cluster Integrative Catalog）是一个跨物种局部同源基因簇整合数据库，收录了从30个代表性真核物种中鉴定出的20 306个局部基因簇。除每个基因簇的基本基因组特征外，用户还可以查看簇内基因成员的序列相似性、同一物种内成簇基因的功能偏好，以及基因簇的跨物种保守性。针对人类基因簇，数据库还提供组织范围表达谱以及与染色质 Hi-C 结构关系的信息。作者表示，LoGIC 可用于串联基因重复、旁系同源基因功能分化、谱系特异性基因家族扩张以及同源基因簇跨物种演化保守或重塑等研究。
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