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DBAASP v4 抗菌肽数据库发布

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AI 综述

抗菌肽活性与结构数据库 DBAASP 发布 v4,条目超过 25 000 条,并从以序列为中心扩展为结构感知的资源库。新版加入 SMILES 表示、链内键与环结构注释、专门的抗生物膜与协同作用记录、PubChem 链接、超过 9200 条分子动力学轨迹以及新的预测服务。 数据库由人工整理,把肽和拟肽与定量的抗菌、抗生物膜、抗癌、溶血和哺乳动物细胞毒性测量及其实验条件关联起来。作者称,这类条件分辨的数据可用于监督学习、菌株与靶点特异模型、模型校准以及遗传算法的替代适合度函数,SMILES 表示还能支持难以仅用序列描述的非天然肽和拟肽建模。 DBAASP v4 在 https://dbaasp.org 免费开放。

AI 根据报道生成 · 48 分钟前更新

报道时间线

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10月31日
  1. Nucleic Acids Research精选
    DBAASP v4 发布:抗菌肽数据库扩展到条件分辨的活性与化学结构

    抗菌肽活性与结构数据库 DBAASP 发布 v4,条目超过 25 000 条,并从以序列为中心扩展为结构感知的资源库。新版系统加入 SMILES 表示、链内键与环结构的注释、专门的抗生物膜与协同作用记录、PubChem 链接、超过 9200 条分子动力学轨迹以及新的预测服务。数据库由人工整理,把肽和拟肽与定量的抗菌、抗生物膜、抗癌、溶血和哺乳动物细胞毒性测量及其实验条件关联起来。作者指出,这类条件分辨的数据可用于监督学习、菌株与靶点特异模型、模型校准以及遗传算法的替代适合度函数,SMILES 表示还能支持难以仅用序列描述的非天然肽和拟肽建模。

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