研究团队提出跨462种哺乳动物基因约束指标GISMO
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研究团队提出跨462种哺乳动物基因约束指标GISMO
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研究团队在462个哺乳动物物种范围内提出两个种间约束指标：GISMO量化按与人类进化距离加权的基因丢失，GISMO-mis以跨哺乳动物错义与同义变异比值衡量错义约束。两者与大规模测序得到的人类功能丧失、错义和剂量约束高度相关，且基本不受编码序列长度影响，能识别人类单一指标漏掉的必需基因，尤其是短基因。 约束最强的十分位基因在精神分裂症、自闭症和神经发育障碍等与生育力下降相关的疾病中富集罕见变异关联，也富集常见变异遗传力，并表现出拷贝数变异减少，与剂量敏感一致。研究团队称，GISMO还改善了隐性致病基因的优先级排序，并捕捉到哺乳动物树上的纯合选择信号。
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最新进展10月20日 08:00
研究团队构建跨 462 个哺乳动物物种的基因丢失与错义变异约束指标 GISMO报道时间线
沿着报道，了解事件的不同侧面。
10月20日
- Nature Genetics精选研究团队构建跨 462 个哺乳动物物种的基因丢失与错义变异约束指标 GISMO
研究团队在 462 个哺乳动物物种范围内提出两个种间约束指标 GISMO 和 GISMO-mis，分别量化按与人类进化距离加权的基因丢失和跨哺乳动物的错义与同义变异比值。两者与大规模测序得到的人类功能丧失、错义和剂量约束高度相关，且基本不受编码序列长度影响，能识别人类单一指标漏掉的必需基因，尤其是短基因。约束最强的十分位基因在精神分裂症、自闭症和神经发育障碍等与生育力下降相关的疾病中富集罕见变异关联，也富集常见变异遗传力，并表现出拷贝数变异减少，与剂量敏感一致。GISMO 还改善了隐性致病基因的优先级排序，并捕捉到哺乳动物树上的纯合选择信号。
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