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Nature Genetics·· 12 小时前精选AI 评分67

研究团队构建跨 462 个哺乳动物物种的基因丢失与错义变异约束指标 GISMO

The landscape of gene loss and missense variation across the mammalian tree informs on gene essentiality

AI 导读

研究团队在 462 个哺乳动物物种范围内提出两个种间约束指标 GISMO 和 GISMO-mis,分别量化按与人类进化距离加权的基因丢失和跨哺乳动物的错义与同义变异比值。两者与大规模测序得到的人类功能丧失、错义和剂量约束高度相关,且基本不受编码序列长度影响,能识别人类单一指标漏掉的必需基因,尤其是短基因。约束最强的十分位基因在精神分裂症、自闭症和神经发育障碍等与生育力下降相关的疾病中富集罕见变异关联,也富集常见变异遗传力,并表现出拷贝数变异减少,与剂量敏感一致。GISMO 还改善了隐性致病基因的优先级排序,并捕捉到哺乳动物树上的纯合选择信号。

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来源:Nature Genetics · doi.org

推荐理由

跨 462 个哺乳动物物种的约束指标能补上人类单一指标漏掉的短基因,对疾病基因优先级排序有直接参考。