酶活性驱动致密生物分子凝聚体运动
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研究团队结合实验、计算与理论方法发现,生物分子凝聚体中的酶催化反应会产生非平衡活性,并通过多种反馈机制与环境耦合,跨越五个数量级的长度尺度。实验显示,凝聚态酶在拥挤蛋白存在时催化更快,这种提升源于高度拥挤环境诱导的低能量蛋白构象;尽管液滴内部拥挤本应提示整体黏度上升,酶活性反而使其更灵活,表现为扩散增强和宏观流动。 日本冲绳科学技术大学院大学联合马克斯·普朗克动力学与自组织研究所和 RIKEN 的后续报道称,用含 BSA 的模型蛋白液滴研究时,酶活性随 BSA 浓度升高先增强、仅在极高浓度下才下降;RIKEN 模拟显示拥挤促使乳酸脱氢酶活性位点由开放转为闭合、降低反应能垒,荧光示踪显示活性酶使液滴内 BSA 与纳米颗粒移动更快,失活酶液滴更黏稠。 作者据此认为,这些结果揭示了酶活性、组成与拥挤在凝聚体中的动态相互作用及其对功能单元迁移性和可及性的影响。后续研究计划检验多酶复合物及细菌体内是否成立。
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报道时间线
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- Phys.org蛋白液滴拥挤可加速酶反应,但过度拥挤则抑制活性
日本冲绳科学技术大学院大学(OIST)联合马克斯·普朗克动力学与自组织研究所(MPI-DS)和 RIKEN,用含 BSA 的模型蛋白液滴研究拥挤环境与酶的相互作用,发现随 BSA 浓度升高酶活性先增强、仅在极高浓度下才下降。RIKEN 的计算机模拟显示,拥挤环境促使乳酸脱氢酶(LDH)活性位点由开放转为闭合,降低反应能垒;荧光示踪实验则表明活性酶使 BSA 与荧光纳米颗粒在液滴内移动更快,失活酶液滴更黏稠。MPI-DS 的理论模型提出酶反应生成化学梯度、驱动微小流动。研究发表于 Nature Communications,下一步将检验多酶复合物及细菌体内是否成立。
- Nature Communications研究发现酶可激活并驱动致密生物分子凝聚体跨尺度运动
研究团队结合实验、计算与理论方法发现,生物分子凝聚体中的酶催化反应会产生非平衡活性,并通过多种反馈机制与环境耦合,跨越五个数量级的长度尺度。实验显示,凝聚态酶在拥挤蛋白存在时催化更快,这种活性提升源于高度拥挤环境诱导的低能量蛋白构象。尽管液滴内部拥挤,本应提示整体黏度上升,但酶活性反而使其更灵活,表现为扩散增强和宏观流动。作者认为,这些结果揭示了酶活性、组成与拥挤在凝聚体中的动态相互作用,以及它们对功能单元迁移性和可及性的影响,拓展了对代谢活跃条件下液液相分离的理解。
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还没有足够的连续观测数据,暂不绘制趋势。