肺炎克雷伯菌全局转录调控网络图谱构建
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肺炎克雷伯菌全局转录调控网络图谱构建
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AI 综述
研究团队在临床分离株 CR-HvKP4 中刻画了 370 个转录因子及其结合谱,构建了肺炎克雷伯菌的全局基因调控网络,并据此鉴定出 25 个关键转录因子。 对 2059 株肺炎克雷伯菌的泛基因组分析显示,转录因子高度保守,序列型内部呈现明显的地理分布模式;时间序列转录组显示超过 88% 的转录因子在各生长阶段维持稳态表达。研究还建立了可跨独立菌株映射转录调控的预测模型,并报告 VmrR(RS15210)缺失显著减弱雌性小鼠肺部的毒力。
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最新进展10月22日 08:00
肺炎克雷伯菌泛基因组全局转录调控网络的拓扑与演化研究报道时间线
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10月22日
- Nature Communications肺炎克雷伯菌泛基因组全局转录调控网络的拓扑与演化研究
研究在临床分离株 CR-HvKP4 中刻画了 370 个转录因子及其结合谱,构建了肺炎克雷伯菌的全局基因调控网络,并通过拓扑分析鉴定和验证了关键的毒力与耐药调控因子。时间序列转录组显示调控效率高度精简,超过 88% 的转录因子在各生长阶段维持稳态表达,中间层转录因子倾向于高水平表达以处理调控信号。对 2059 株肺炎克雷伯菌的泛基因组分析显示转录因子高度保守,序列型内部呈现明显的地理分布模式。研究还建立了可跨独立菌株准确映射转录调控的预测模型,共鉴定出 25 个关键转录因子和两个生长阶段的 4 个转录因子调控子,其中 VmrR(RS15210)缺失显著减弱了雌性小鼠肺部的毒力。
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