肺炎克雷伯菌泛基因组全局转录调控网络的拓扑与演化研究

研究在临床分离株 CR-HvKP4 中刻画了 370 个转录因子及其结合谱，构建了肺炎克雷伯菌的全局基因调控网络，并通过拓扑分析鉴定和验证了关键的毒力与耐药调控因子。时间序列转录组显示调控效率高度精简，超过 88% 的转录因子在各生长阶段维持稳态表达，中间层转录因子倾向于高水平表达以处理调控信号。对 2059 株肺炎克雷伯菌的泛基因组分析显示转录因子高度保守，序列型内部呈现明显的地理分布模式。研究还建立了可跨独立菌株准确映射转录调控的预测模型，共鉴定出 25 个关键转录因子和两个生长阶段的 4 个转录因子调控子，其中 VmrR（RS15210）缺失显著减弱了雌性小鼠肺部的毒力。