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SpliceAI预计算分数存偏差,团队发布splint工具

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AI 综述

Genome Medicine 论文作者发布命令行工具 SpliceAI-splint,用于在 VCF 文件中找出那些剪接效应会被预计算 SpliceAI 分数漏掉的变异。该工具针对的是预计算分数与 MANE v1.0 Select 转录本注释、基因组版本不一致的问题。 研究团队用 SpliceAI 重新分析了 Genomics England 100,000 Genomes Project 中 7,221 名神经发育障碍患者的 660 个相关基因变异,并回顾性对照已确诊结果评估。作者称,与 MANE v1.0 Select 比对后,8.34% 的理论 SNV 受影响,34.98% 的 PanelApp green 疾病基因的预测准确性受波及。

AI 根据报道生成 · 3 小时前更新

报道时间线

沿着报道,了解事件的不同侧面。

10月27日
  1. Genome Medicine
    用 SpliceAI 筛查 7,220 名罕见病患者的剪接变异,揭示预计算分数的局限

    研究团队用 SpliceAI 对 Genomics England 100,000 Genomes Project 中 7,221 名神经发育障碍(NDD)患者的 660 个相关基因变异重新分析,发现预计算 SpliceAI 分数存在注释与基因组版本不一致的问题。与 MANE v1.0 Select 转录本比对后,8.34% 的理论 SNV 受影响,34.98% 的 PanelApp green 疾病基因的预测准确性受波及。

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