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模拟显示D-逆反肽可扰动TTR纤维结构

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AI 综述

一项发表于《Journal of Chemical Information and Modeling》的计算研究显示,D-逆反肽 DRI-K6V 在分子动力学模拟中可扰动转甲状腺素蛋白(TTR)纤维的结构完整性,K80-S100 片段被确定为调控纤维稳定性的潜在靶点。 研究团队从 TTR 序列的聚集倾向区域构建肽库(含 WALTZ-DB 2.0 淀粉样肽数据),按破坏纤维柔性区相互作用的能力筛出三条候选肽,经 HADDOCK 2.4 对接至 TTR 纤维表面后做全原子分子动力学模拟。作者称,该机制或为针对已形成 TTR 淀粉样变性的肽类药物设计提供路径;上述结果来自模拟,尚未经实验验证。

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10月27日
  1. Journal of Chemical Information and Modeling
    用 D-retro-inverso 肽调控转甲状腺素蛋白(TTR)纤维稳定性

    分子动力学模拟显示,D-retro-inverso(DRI)肽 DRI-K6V 可扰动转甲状腺素蛋白(TTR)纤维的结构完整性,K80-S100 片段被确定为调控 TTR 纤维稳定性的潜在靶点。研究从 TTR 序列的聚集倾向区域构建肽库,包括来自淀粉样肽数据库 WALTZ-DB 2.0 的肽段,并依据破坏纤维结构柔性区域相互作用的能力筛选出三条候选肽。候选肽经 HADDOCK 2.4 对接至 TTR 纤维表面,随后用全原子分子动力学模拟评估肽–纤维相互作用及其对纤维结构的影响。作者提出,该结果或为针对已形成的 TTR 淀粉样变性的肽类药物设计开辟路径。

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