从头设计SARS-CoV-2结合蛋白揭示结合与自缔合权衡

研究团队以SARS-CoV-2受体结合域（RBD）为靶标开展两轮从头蛋白结合蛋白设计，刻意在结合能力与单体行为之间设置不同取舍。22个原始设计均未检测到对RBD的可测结合，并呈现两类失败模式：一类保持单体但靶标结合不足，另一类结合界面更有竞争力，却因表面疏水性过强而自缔合。 作者整合AlphaFold预测、分子动力学模拟、对接分析和表面聚集倾向（SAP）计算，建立了区分这两类失败模式的计算特征，并揭示其结构决定因素。 经SEC-MALS、表面等离子共振和圆二色谱表征，重新设计的变体为稳定单体，并获得低微摩尔级结合亲和力。

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还没有足够的连续观测数据，暂不绘制趋势。