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血液处理延迟揭示TCR核心克隆型

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AI 综述

研究团队在211例新诊断结直肠癌患者的外周血TCRβ免疫组库中，比较了采血后尽快处理与延迟处理两种条件下的样本，发现延迟处理会降低克隆型丰富度、耗竭singleton克隆型并优先丢失低频组分。该团队据此将两种处理条件下均检出的氨基酸序列一致的CDR3β定义为CORE克隆型（COnsistent Repertoire Elements），并从丰度分布、V/J基因使用、氨基酸组成、核苷酸冗余、密码子使用、生化性质与相关网络等层面加以刻画。研究发表于BMC Bioinformatics。

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最新进展10月23日 08:00

CORE clonotypes：血液处理时间差异揭示外周 TCR 免疫组库的可重复结构组分

报道时间线

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10月23日

08:00
BMC Bioinformatics
CORE clonotypes：血液处理时间差异揭示外周 TCR 免疫组库的可重复结构组分
对 211 例新诊断结直肠癌患者的外周血 TCRβ 免疫组库分析显示，血液采集后处理延迟会降低 clonotype 丰富度、耗竭 singleton clonotype，并优先丢失低频组分。研究据此将两种处理条件下均检出的氨基酸序列一致的 CDR3β 定义为 CORE clonotypes（COnsistent Repertoire Elements），并从丰度分布、V/J 基因使用、氨基酸组成、核苷酸冗余、密码子使用、生化性质与相关网络多个层面加以刻画。

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