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BMC Bioinformatics·· 1 天前AI 评分35

CORE clonotypes:血液处理时间差异揭示外周 TCR 免疫组库的可重复结构组分

CORE clonotypes: a reproducible structural component of the peripheral TCR repertoire revealed through variation in blood processing times

AI 导读

对 211 例新诊断结直肠癌患者的外周血 TCRβ 免疫组库分析显示,血液采集后处理延迟会降低 clonotype 丰富度、耗竭 singleton clonotype,并优先丢失低频组分。研究据此将两种处理条件下均检出的氨基酸序列一致的 CDR3β 定义为 CORE clonotypes(COnsistent Repertoire Elements),并从丰度分布、V/J 基因使用、氨基酸组成、核苷酸冗余、密码子使用、生化性质与相关网络多个层面加以刻画。

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来源:BMC Bioinformatics · doi.org