287例人骨骼肌单核多组学图谱与QTL定位
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287例人骨骼肌单核多组学图谱与QTL定位
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研究团队在287例冷冻人骨骼肌活检上,用遗传多重标记构建了群体规模的单核染色质可及性(snATAC-seq)与转录组(snRNA-seq)图谱,鉴定出13种细胞类型。 整合遗传变异后,团队在各细胞类型中共发现超过7,000个表达数量性状位点(eQTL)和超过100,000个染色质可及性QTL(caQTL),其中包括具有显著G×C交互作用的上下文特异eQTL/caQTL。作者还识别出近2,000个与caQTL共定位的eGene,并构建了染色质可及性与基因表达的因果方向图谱。
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最新进展10月28日 08:00
287 例人骨骼肌单核多组学图谱揭示细胞类型特异的遗传调控报道时间线
沿着报道,了解事件的不同侧面。
10月28日
- Nature Genetics精选287 例人骨骼肌单核多组学图谱揭示细胞类型特异的遗传调控
研究团队用遗传多重标记在 287 例冷冻人骨骼肌活检上构建了群体规模的单核染色质可及性(snATAC-seq)与转录组(snRNA-seq)图谱,鉴定出 13 种细胞类型。整合遗传变异后,在各细胞类型中共发现超过 7,000 个表达数量性状位点(eQTL)和超过 100,000 个染色质可及性 QTL(caQTL),其中包括具有显著 G × C 交互作用的上下文特异 eQTL/caQTL。作者识别出近 2,000 个与 caQTL 共定位的 eGene,并构建了染色质可及性与基因表达的因果方向图谱。
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