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287例人骨骼肌单核多组学图谱与QTL定位

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AI 综述

研究团队在287例冷冻人骨骼肌活检上,用遗传多重标记构建了群体规模的单核染色质可及性(snATAC-seq)与转录组(snRNA-seq)图谱,鉴定出13种细胞类型。 整合遗传变异后,团队在各细胞类型中共发现超过7,000个表达数量性状位点(eQTL)和超过100,000个染色质可及性QTL(caQTL),其中包括具有显著G×C交互作用的上下文特异eQTL/caQTL。作者还识别出近2,000个与caQTL共定位的eGene,并构建了染色质可及性与基因表达的因果方向图谱。

AI 根据报道生成 · 42 分钟前更新

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10月28日
  1. Nature Genetics精选
    287 例人骨骼肌单核多组学图谱揭示细胞类型特异的遗传调控

    研究团队用遗传多重标记在 287 例冷冻人骨骼肌活检上构建了群体规模的单核染色质可及性(snATAC-seq)与转录组(snRNA-seq)图谱,鉴定出 13 种细胞类型。整合遗传变异后,在各细胞类型中共发现超过 7,000 个表达数量性状位点(eQTL)和超过 100,000 个染色质可及性 QTL(caQTL),其中包括具有显著 G × C 交互作用的上下文特异 eQTL/caQTL。作者识别出近 2,000 个与 caQTL 共定位的 eGene,并构建了染色质可及性与基因表达的因果方向图谱。

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