古病毒插入沉默黑猩猩LINC00662基因
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瑞典隆德大学研究团队在 Science Advances 发表研究称,黑猩猩基因组中的内源逆转录病毒 PTERV1 插入通过 DNA 甲基化沉默 LINC00662 基因,而该基因在人类早期大脑发育中活跃。研究者用人和黑猩猩干细胞构建脑类器官,发现 LINC00662 在人类类器官中强表达、在黑猩猩类器官中完全不表达;用 CRISPR-Cas9 删除黑猩猩细胞中的病毒序列后,该基因恢复表达。 对黑猩猩神经类器官中 PTERV1 插入的表观基因组分析显示,这些插入高度甲基化,形成超过 150 个物种特异性异染色质结构域;其中 19 号染色体上一个黑猩猩特有的插入通过甲基化扩散沉默 LINC00662。在人类脑类器官中用 CRISPR 沉默 LINC00662,会降低神经细胞发育及神经细胞间连接形成相关基因的活性。 作者据此提出内源逆转录病毒插入促成人脑与黑猩猩脑分化的机制。
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- Phys.org黑猩猩基因组中的古病毒插入关闭了人类活跃的 LINC00662 基因
瑞典隆德大学的研究团队在 Science Advances 发表研究,发现黑猩猩基因组中的内源逆转录病毒 PTERV1 插入使 LINC00662 基因被甲基化沉默,而该基因在人类早期大脑发育中活跃。研究者用人和黑猩猩干细胞构建脑类器官,LINC00662 在人类类器官中强表达、在黑猩猩类器官中完全不表达;用 CRISPR-Cas9 删除黑猩猩细胞中的病毒序列后基因恢复表达。在人类脑类器官中用 CRISPR 沉默 LINC00662,会降低神经细胞发育及神经细胞间连接形成相关基因的活性。
- Science Advances逆转录病毒插入通过沉默 LINC00662 参与人脑与黑猩猩脑的分化
研究分析了黑猩猩神经类器官中 PTERV1 内源逆转录病毒插入的表观基因组特征,发现这些插入高度 DNA 甲基化,形成超过 150 个物种特异性异染色质结构域,可能影响基因调控。其中 19 号染色体上一个黑猩猩特有的插入通过 DNA 甲基化扩散沉默长链非编码 RNA LINC00662;用 CRISPR 删除该插入后,黑猩猩诱导多能干细胞中 LINC00662 的表达得以恢复。LINC00662 是在脑发育期表达的人类特异性转录本,参与神经元成熟、轴突生长和神经类器官发育。作者据此提出内源逆转录病毒插入促成人脑与黑猩猩脑分化的机制。
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