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研究团队构建嵌合RNA图谱并筛选功能必需嵌合RNA

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AI 综述

研究团队构建整合预测流程,在1019个癌细胞系中建立包含569,640条嵌合RNA的图谱,并结合癌症依赖图谱(DepMap)的扰动数据开展系统性功能依赖筛选,从预测推进到识别对细胞过程必需的高置信功能嵌合RNA,其中包括由相邻基因顺式剪接产生的一类复现性嵌合转录本。 团队称,敲低部分候选嵌合体可干扰细胞周期进程和细胞适合度,这些转录本在原发乳腺肿瘤中也常出现失调。作者据此认为,嵌合RNA构成一层此前被低估的基因表达,把功能基因组扩展到传统遗传学之外。

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报道时间线

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10月31日
  1. Science Advances
    整合预测与功能依赖图谱在活跃转录组中发现关键嵌合 RNA

    研究团队构建整合预测流程,在 1019 个癌细胞系中建立了包含 569,640 条嵌合 RNA 的图谱,并结合癌症依赖图谱(DepMap)项目的扰动数据开展系统性功能依赖筛选,从预测推进到识别对细胞过程必需的高置信功能嵌合 RNA,其中包括由相邻基因顺式剪接产生的一类复现性嵌合转录本。敲低部分候选嵌合体可干扰细胞周期进程和细胞适合度,这些转录本在原发乳腺肿瘤中也常出现失调。作者认为,嵌合 RNA 构成一层此前被低估的基因表达,把功能基因组扩展到传统遗传学之外。

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