整合预测与功能依赖图谱在活跃转录组中发现关键嵌合 RNA

研究团队构建整合预测流程，在 1019 个癌细胞系中建立了包含 569,640 条嵌合 RNA 的图谱，并结合癌症依赖图谱（DepMap）项目的扰动数据开展系统性功能依赖筛选，从预测推进到识别对细胞过程必需的高置信功能嵌合 RNA，其中包括由相邻基因顺式剪接产生的一类复现性嵌合转录本。敲低部分候选嵌合体可干扰细胞周期进程和细胞适合度，这些转录本在原发乳腺肿瘤中也常出现失调。作者认为，嵌合 RNA 构成一层此前被低估的基因表达，把功能基因组扩展到传统遗传学之外。