MMC-seq 低起始量长读长 eccDNA 分析流程发布
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MMC-seq 低起始量长读长 eccDNA 分析流程发布
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AI 综述
研究团队在 Nature Communications 发表 Multi-Modal Circle-seq(MMC-seq),将优化富集与 PacBio HiFi 长读长测序结合,并配套 CircleSeeker 软件,用于重建和分类 unique-locus、multi-locus 与 chimeric 三类环状 DNA(eccDNA)。 据论文,流程优化后在配对的 30 万细胞样本中检测量提升 38.7 倍;CircleSeeker 在平台匹配的人类 unique-locus 模拟数据中 F1 分数超过 96%。MMC-seq 可分析单细胞制备样本和冻存肿瘤组织,并支持从 100 μL 血浆获得基于大小的读数;论文报告一例胶质肉瘤产出超过一百万个 eccDNA,包括 EGFR 扩增区域内的嵌套环。上述提升与准确率均为论文报告的结果。
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最新进展11月4日 08:00
MMC-seq 实现低起始量样本的高效长读长 eccDNA 分析报道时间线
沿着报道,了解事件的不同侧面。
11月4日
- Nature Communications精选MMC-seq 实现低起始量样本的高效长读长 eccDNA 分析
研究团队提出 Multi-Modal Circle-seq(MMC-seq),将优化富集与 PacBio HiFi 测序结合,并配套 CircleSeeker 用于重建和分类 unique-locus、multi-locus 与 chimeric 三类环状 DNA。流程优化后,在配对的 30 万细胞样本中检测量提升 38.7 倍;CircleSeeker 在平台匹配的人类 unique-locus 模拟数据中 F1 分数超过 96%。MMC-seq 可分析单细胞制备样本和冻存肿瘤组织,并能从 100 μL 血浆中获得基于大小的读数。
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