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MMC-seq 低起始量长读长 eccDNA 分析流程发布

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AI 综述

研究团队在 Nature Communications 发表 Multi-Modal Circle-seq(MMC-seq),将优化富集与 PacBio HiFi 长读长测序结合,并配套 CircleSeeker 软件,用于重建和分类 unique-locus、multi-locus 与 chimeric 三类环状 DNA(eccDNA)。 据论文,流程优化后在配对的 30 万细胞样本中检测量提升 38.7 倍;CircleSeeker 在平台匹配的人类 unique-locus 模拟数据中 F1 分数超过 96%。MMC-seq 可分析单细胞制备样本和冻存肿瘤组织,并支持从 100 μL 血浆获得基于大小的读数;论文报告一例胶质肉瘤产出超过一百万个 eccDNA,包括 EGFR 扩增区域内的嵌套环。上述提升与准确率均为论文报告的结果。

AI 根据报道生成 · 2 小时前更新

报道时间线

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11月4日
  1. Nature Communications精选
    MMC-seq 实现低起始量样本的高效长读长 eccDNA 分析

    研究团队提出 Multi-Modal Circle-seq(MMC-seq),将优化富集与 PacBio HiFi 测序结合,并配套 CircleSeeker 用于重建和分类 unique-locus、multi-locus 与 chimeric 三类环状 DNA。流程优化后,在配对的 30 万细胞样本中检测量提升 38.7 倍;CircleSeeker 在平台匹配的人类 unique-locus 模拟数据中 F1 分数超过 96%。MMC-seq 可分析单细胞制备样本和冻存肿瘤组织,并能从 100 μL 血浆中获得基于大小的读数。

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