Nature Communications·· 11 小时前精选AI 评分65
MMC-seq 实现低起始量样本的高效长读长 eccDNA 分析
MMC-seq enables efficient long-read eccDNA profiling from low-input samples
AI 导读
研究团队提出 Multi-Modal Circle-seq（MMC-seq），将优化富集与 PacBio HiFi 测序结合，并配套 CircleSeeker 用于重建和分类 unique-locus、multi-locus 与 chimeric 三类环状 DNA。流程优化后，在配对的 30 万细胞样本中检测量提升 38.7 倍；CircleSeeker 在平台匹配的人类 unique-locus 模拟数据中 F1 分数超过 96%。MMC-seq 可分析单细胞制备样本和冻存肿瘤组织，并能从 100 μL 血浆中获得基于大小的读数。
阅读原文
来源：Nature Communications · doi.org
推荐理由
面对低起始量样本的 eccDNA 研究，这套流程把富集优化、PacBio HiFi 长读长测序和结构分类串成一条可复用的分析路径。