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FITdb功能免疫基因组与转录组数据库发布

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AI 综述

研究团队在 Nucleic Acids Research 发布功能免疫基因组学与转录组学数据库 FITdb,用于整合免疫细胞功能基因组学数据,并称其可免费访问(https://fitdb.lji.org)。 FITdb 目前收录 43 项独立功能遗传筛选,其中 31 项为 bulk 筛选、12 项为单细胞筛选,覆盖 20 696 个小鼠基因和 22 293 个人类基因,涉及 199 种免疫细胞类型与细胞状态、29 种实验条件。团队称所有数据集均用统一流程重新分析,以支持跨研究探索。 数据库提供以基因为中心的可视化、单项筛选的详细浏览以及 single-guide RNA 层级数据。

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报道时间线

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10月23日
  1. Nucleic Acids Research
    FITdb 发布整合功能免疫基因组学与转录组学数据库

    研究团队开发了可免费访问的功能免疫基因组学与转录组学数据库 FITdb,用于整合免疫细胞功能基因组学数据。FITdb 目前收录 43 项独立功能遗传筛选,其中 31 项为 bulk 筛选、12 项为单细胞筛选,覆盖 20 696 个小鼠基因和 22 293 个人类基因,涉及 199 种免疫细胞类型与细胞状态、29 种实验条件。所有数据集都用统一流程重新分析,以支持跨研究探索;数据库提供以基因为中心的可视化、单项筛选的详细浏览以及 single-guide RNA 层级数据。

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