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胃癌多阶段染色质图谱定义酸性微环境耐药亚型

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AI 综述

卞修武、王斌、白凡、王振宁等团队在 Cancer Cell 发表研究,基于 439 名受试者的 650 份多阶段胃组织样本,用 bulk ATAC-seq、scATAC-seq 及配对 RNA-seq、snRNA-seq 绘制了从正常黏膜、胃炎、肠上皮化生到胃癌的染色质可及性图谱。研究称,肠化生阶段已出现染色质提前开放的“许可态”,ATF3 等转录因子参与其中。 研究将进展期胃癌分为增殖型、间质-炎症型和拟胃型三种表观亚型;拟胃型在 FOSL2 部分驱动下上调 H⁺/K⁺-ATP 酶、构建酸性微环境,抑制 CD8⁺ T 细胞。86 份胃癌样本来自新辅助免疫化疗 II 期临床试验队列(NCT05515796)。 在临床前模型及回顾性分析中,钾离子竞争性酸阻滞剂伏诺拉生可减轻该耐药表型;研究团队表示,其临床获益仍需前瞻性随机对照试验验证。

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11月2日
  1. 公众号:生信人精选
    卞修武团队在 Cancer Cell 绘制胃癌多阶段染色质图谱并定义酸性微环境耐药亚型

    卞修武、王斌、白凡、王振宁等团队在 Cancer Cell 发表研究,依托439名受试者的650份多阶段胃组织样本,用 bulk ATAC-seq、scATAC-seq 及配对 RNA-seq、snRNA-seq 绘制了从正常黏膜、胃炎、肠上皮化生到胃癌的染色质可及性图谱。研究发现肠化生阶段已出现染色质提前开放的许可态,ATF3 等转录因子参与其中;进展期胃癌可分为增殖型、间质-炎症型和拟胃型三种表观亚型,拟胃型在 FOSL2 部分驱动下上调 H⁺/K⁺-ATP 酶、构建酸性微环境抑制 CD8⁺ T 细胞。

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