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卞修武团队在 Cancer Cell 绘制胃癌多阶段染色质图谱并定义酸性微环境耐药亚型
Cancer Cell |卞修武院士团队绘制迄今最大胃癌多阶段全景图谱,老药新用破解免疫治疗原发耐药难题
AI 导读
卞修武、王斌、白凡、王振宁等团队在 Cancer Cell 发表研究,依托439名受试者的650份多阶段胃组织样本,用 bulk ATAC-seq、scATAC-seq 及配对 RNA-seq、snRNA-seq 绘制了从正常黏膜、胃炎、肠上皮化生到胃癌的染色质可及性图谱。研究发现肠化生阶段已出现染色质提前开放的许可态,ATF3 等转录因子参与其中;进展期胃癌可分为增殖型、间质-炎症型和拟胃型三种表观亚型,拟胃型在 FOSL2 部分驱动下上调 H⁺/K⁺-ATP 酶、构建酸性微环境抑制 CD8⁺ T 细胞。
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来源:公众号:生信人 · mp.weixin.qq.com
推荐理由
研究用650份多阶段胃组织样本构建染色质可及性图谱,把胃癌免疫耐药拆到表观亚型与酸性微环境这一层。