DockBind 发布蛋白-配体复合物数据集
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DockBind 发布蛋白-配体复合物数据集
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AI 综述
《Journal of Chemical Information and Modeling》作者团队发布 DockBind 数据集：18,332 个经质量控制的建模蛋白-配体复合物，覆盖 612 个蛋白靶点，每个复合物配有实验结合亲和力数据。 作者称，该数据集用于训练和基准评测机器学习打分函数。其构建方式是先比较自由对接与模板对接，并用基于配体相似性和最大公共子结构（MCS）的构象过滤选出最接近真实的构象，形成受控对接流程；再将该流程接入整合 Binding MOAD、Protein Data Bank、ChEMBL 和 BindingDB 结构与亲和力数据的流水线。作者称所得结构可靠性高、化学多样性好。
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最新进展10月27日 01:01
DockBind 发布带亲和力数据的受控建模蛋白-配体复合物数据集报道时间线
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10月27日
- Journal of Chemical Information and ModelingDockBind 发布带亲和力数据的受控建模蛋白-配体复合物数据集
DockBind 是一个经质量控制的建模蛋白-配体复合物数据集，每个复合物都配有实验结合亲和力数据，用于训练和基准评测机器学习打分函数。作者基于扩展的对接基准系统评估了自由对接与模板对接方法，以及基于配体相似性和最大公共子结构（MCS）的构象过滤，从中选出最接近真实的构象，形成受控对接流程。该流程随后接入一条整合 Binding MOAD、Protein Data Bank、ChEMBL 和 BindingDB 结构与亲和力数据的流水线，最终得到覆盖 612 个蛋白靶点的 18,332 个复合物，作者称其结构可靠性高、化学多样性好。
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