DockBind 发布带亲和力数据的受控建模蛋白-配体复合物数据集

DockBind 是一个经质量控制的建模蛋白-配体复合物数据集，每个复合物都配有实验结合亲和力数据，用于训练和基准评测机器学习打分函数。作者基于扩展的对接基准系统评估了自由对接与模板对接方法，以及基于配体相似性和最大公共子结构（MCS）的构象过滤，从中选出最接近真实的构象，形成受控对接流程。该流程随后接入一条整合 Binding MOAD、Protein Data Bank、ChEMBL 和 BindingDB 结构与亲和力数据的流水线，最终得到覆盖 612 个蛋白靶点的 18,332 个复合物，作者称其结构可靠性高、化学多样性好。