图泛基因组揭示异源多倍化对结构变异的影响
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图泛基因组揭示异源多倍化对结构变异的影响
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AI 综述
研究团队以经历多次异源多倍化的酵母 Brettanomyces bruxellensis 为模型，整合亚基因组分辨组装与群体规模基因组、转录组数据构建参考图泛基因组，在 1060 个分离株中检测到 5972 个独特结构变异（SV）。 异源多倍体基因组平均携带 320 个 SV，显著多于二倍体的 116 个；27.5% 的 SV 局部影响基因表达，源自亚基因组祖先分化的杂交相关 SV 形成结构多样性热点，其对基因表达的影响效应量大于其他 SV。 研究据此称，异源多倍化驱动了结构与功能层面的基因组多样化，图泛基因组方法有助于解析复杂基因组演化。
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最新进展10月31日 01:58
基于图泛基因组分析揭示异源多倍化事件的结构与功能影响报道时间线
沿着报道，了解事件的不同侧面。
10月31日
- Science Advances基于图泛基因组分析揭示异源多倍化事件的结构与功能影响
研究以经历多次异源多倍化事件的酵母 Brettanomyces bruxellensis 为模型，整合亚基因组分辨的组装与群体规模基因组、转录组数据，构建参考图泛基因组，在 1060 个分离株中检测到 5972 个独特结构变异（SV）。异源多倍体基因组平均携带 320 个 SV，显著多于二倍体的 116 个。功能关联分析显示 27.5% 的 SV 局部影响基因表达；源自亚基因组祖先分化的杂交相关 SV 形成结构多样性热点，对基因表达的影响效应量大于其他 SV。结果表明异源多倍化驱动了结构与功能层面的基因组多样化，图泛基因组方法有助于解析复杂基因组演化。
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