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Science Advances·· 3 小时前AI 评分40

基于图泛基因组分析揭示异源多倍化事件的结构与功能影响

Graph-based pangenome analysis uncovers structural and functional impacts of allopolyploidization events

AI 导读

研究以经历多次异源多倍化事件的酵母 Brettanomyces bruxellensis 为模型,整合亚基因组分辨的组装与群体规模基因组、转录组数据,构建参考图泛基因组,在 1060 个分离株中检测到 5972 个独特结构变异(SV)。异源多倍体基因组平均携带 320 个 SV,显著多于二倍体的 116 个。功能关联分析显示 27.5% 的 SV 局部影响基因表达;源自亚基因组祖先分化的杂交相关 SV 形成结构多样性热点,对基因表达的影响效应量大于其他 SV。结果表明异源多倍化驱动了结构与功能层面的基因组多样化,图泛基因组方法有助于解析复杂基因组演化。

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来源:Science Advances · doi.org