南科大团队发表长读长泛癌转录组研究

南方科技大学附属佛山医院邓裕华与中山大学中山眼科中心肖传乐等人在 iMetaMed 发表研究，用 Nanopore 长读长 RNA 测序分析 10 种器官的 144 对肿瘤与癌旁配对样本，发现基因表达与转录本异构体表达呈现不同的变化趋势。研究共鉴定 296,465 个异构体，其中 77.3% 可在现有数据库中找到注释；肿瘤在基因层面表现出与癌性去分化相关的趋同表达，而异构体层面的改变具有器官特异性，且部分独立于基因表达变化。 作者称，该框架旨在筛选候选预后生物标志物和治疗靶点；但由于队列缺少临床分期和治疗结局数据，不适用于肿瘤早期筛查或疗效预测。研究检出的异构体改变、肿瘤特异性异构体和复发性融合事件均为群体平均信号，无法明确归属于恶性细胞或肿瘤微环境中的特定细胞状态。全部代码已公开。

AI 根据报道生成 · 2 小时前更新

还没有足够的连续观测数据，暂不绘制趋势。